Первый русский православный приход в Швейцарии, созданный в Берне по Императорскому указу от 24 декабря 1816 г., окормляли следующие священники: с февраля 1817 г. по 1830 г. – священник Василий Разумовский; с 1830 по 1832 гг. – священник Симеон Красноцветов; с 1832. по 1836 гг. – священник Иоанн Гуляев; с 1836 по 1838 гг. – священник Иоанн Грацианский; с 1838 по 1847 гг. – священник Лев Каченовский (в 1842 г. возведен в сан протоиерея); с мая 1847 г. по 1848 г. – священник Василий Полисадов.
С 1848 по 1854 гг., русская церковь в Берне была по политическим причинам закрыта, а в ноябре 1854 г. приход был переведен в Женеву и до сентября 1866 г. службы отправлялись в частной вилле XIII в. на улице О’Вив, сначала протоиереем Арсением Судаковым, а впоследствии протоиереем Афанасием Петровым.
Из письма Л.Н.Толстого Т.А.Ергольской (от 29 мая 1857г.) об А.Петрове:
«Священник наш молодой, но умный, образованный и исключительно прекрасной жизни человек и всех наш духовный отец, которого я полюбил душевно и который, надеюсь, полюбил меня немного». Михаил Шишкин «Русская Швейцария.
В 1854 году в Женеве официально появилась первая русская православная община. Настоятель действующего в то время храма, располагавшегося в частной вилле XIII в. на улице О’Вив, протоиерей Афанасий Константинович Петров, урожениц Астраханской губернии, стал инициатором строительства новой церкви. В 1863 году Большой Совет Женевы, рассмотрев его просьбу, дал разрешение на строительство «часовни для богослужения по греческому чину» на месте бывших крепостных укреплений, в квартале Ле Транше, пожертвовав участок земли. Закладка церкви состоялась 14/26 сентября 1863 года в присутствии герцогов Сергея и Георгия Лейхтенбергских, принца Николая Ольденбургского, русского посланника А. П. Озерова и представителей кантональных и городских властей.
Три года спустя, 14/26 сентября 1866 года в престольный праздник, церковь была торжественно освящена тремя протоиереями: Иосифом Васильевым из Парижа, Афанасием Петровым из Женевы, Василием Прилежаевым из Ниццы и священником Владимиром Ладинским из Веймара. Об этом событии напоминает мраморная доска в притворе женевского собора.
Из текста доклада, направленного послом А. П. Озеровым в Петербург министру иностранных дел А. М. Горчакову:
«Вчера, 14 (26) сентября, происходило в Женеве торжественное освящение нового храма во имя Воздвижения Креста Господня… После тоста, провозглашенного мной за здравие нашего многолюбимого монарха и всего царского дома, который принят был с общим восторгом и дружным „ура!“, я произнес несколько слов благодарности и сочувствия Швейцарии и республике Женевской. Здесь позволил я себе припомнить столь красноречиво и воодушевленно высказанную недавно в.с-вом политическую истину, что связь и дружба между нациями тогда только знаменательны и прочны, когда не основаны на своекорыстных расчетах. Этим словам, повторенным моей скромной речью, конечно, обязан я громким и единодушным рукоплесканиям, которыми почтили меня присутствовавшие». Михаил Шишкин «Русская Швейцария».
“Храм был построен по проекту известного русского архитектора Давида Ивановича Гримма (1823-1898) в старинном московском стиле, с девятью куполами. Однако в самом начале своего существования храм таким не был. Первоначальные планы предусматривали строительство рядом с храмом величественной колокольни. Осуществить этот проект не удалось, и лишь полвека спустя, перед самой релюцией, была пристроена колокольня, правда куда меньших размеров, и увеличено само пространство храма”. И.И.Грезин “Из истории строительства русских храмов в Швейцарии”.
Настоятель храма протоиерей Сергий Иоаннович Орлов, пробывший в своей должности почти 40 лет, решил провести и значительные реставрационные работы внутри храма: были заново расписаны стены и элементы декора.
По случаю 50-летия церкви было принято решение расширить здание с западной стороны: нефы собора были существенно увеличены за счет пристройки над центральным крыльцом колокольни со звонницей из пяти колоколов.
Проект осуществлялся архитектурным бюро Pittard & Graf. Колокола были заказаны в мае 1918 года на литейном заводе Rüetschi в Арау, который доставил их в сентябре того же года. Женева услышала их звучание в праздник Рождества Божией Матери, 8/21 сентября.
Для финансирования строительных работ пришлось отказаться от права пользования зданием, расположенным напротив церкви.
Освящение храма и звонницы по окончании работ запечатлено на фотографиях, датированных 12/25 февраля 1917 года.
В 1918 году сербское правительство «в благодарность за благодатно-молитвенное утешение сербской колонии в период скорбного её укрывательства в Женеве по разорении Сербии» подарило церкви второй по величине колокол для звонницы женевского храма.
На колоколе имеется надпись «Пожертвование cербов».